SGF/IQCS überwacht auf Basis kontinuierlicher Probenkäufe in den Verbrauchermärkten die Sicherheit, Qualität und Kennzeichnung von Frucht- und Gemüsesäften, Nektaren und fruchtsafthaltigen Getränken. Da die Produkte der FKS-Teilnehmer bereits regelmäßig in unangemeldeten Betriebskontrollen überwacht werden, zielen die Marktkontrollen ergänzend und in erster Linie auf Importprodukte sowie auf Produkte von Abfüllern, die (noch) nicht am Kontrollsystem teilnehmen.
Die Probenziehungen und Analysen erfolgen unter dem Gesichtspunkt einer marktspezifischen Risikoabschätzung. Das bedeutet, einzelne Produktkategorien werden nach ihrer Marktbedeutung und Verbraucherpräferenz ausgewählt. Auch Produkte mit einem auffallend niedrigen Preis werden bevorzugt untersucht.
Festgestellte Qualitätsmängel werden mit Beanstandungen und der Durchsetzung von Korrekturmaßnahmen bei den betroffenen Herstellern nachbearbeitet und abgestellt.